阳离子色谱柱基于离子交换的原理进行分离。在色谱柱中填充了离子交换树脂，当样品进入色谱柱后，不同离子与树脂上的离子交换位点发生竞争性吸附。由于不同离子与交换位点的亲和力不同，它们在柱中的保留时间也不同，从而实现了离子的分离。例如，对于阳离子交换柱，阳离子与树脂上的氢离子进行交换；对于阴离子交换柱，阴离子与树脂上的氢氧根离子进行交换。

阴离子色谱柱基于离子交换的原理进行分离。在色谱柱中填充了离子交换树脂，当样品进入色谱柱后，不同离子与树脂上的离子交换位点发生竞争性吸附。由于不同离子与交换位点的亲和力不同，它们在柱中的保留时间也不同，从而实现了离子的分离。例如，对于阳离子交换柱，阳离子与树脂上的氢离子进行交换；对于阴离子交换柱，阴离子与树脂上的氢氧根离子进行交换。

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